1959年1月鐵道部公布《1960—1967年鐵路高校專業(yè)（全日制）學(xué)校發(fā)展規(guī)劃草案》。4月鐵道部在成都召開全路高等學(xué)校及中等專業(yè)學(xué)校教育工作會(huì)議，會(huì)議傳達(dá)貫徹中共中央教育工作會(huì)議關(guān)于“整頓、鞏固、提高”的工作方針，在總結(jié)1958年工作的基礎(chǔ)上，提出1959年的工作任務(wù)和目標(biāo)，著重討論了關(guān)于加強(qiáng)學(xué)校統(tǒng)一管理、調(diào)整新建高等學(xué)校以及提高教育質(zhì)量的措施等問題，確定了6條整頓的原則和具體方案，提出每省1所大學(xué)的布局；會(huì)議討論了鐵道部《關(guān)于加強(qiáng)全日制高等學(xué)校和中等專業(yè)學(xué)校統(tǒng)一管理問題的若干規(guī)定（草案）》、《關(guān)于整頓1958年新建高等學(xué)校意見》等文件。6月鐵道部發(fā)文規(guī)范鐵路高校校名和學(xué)制。規(guī)定：鐵道部直屬高校，均以“鐵道學(xué)院”命名，并冠以該院校所在地名；各局、院、廠所屬高等學(xué)校鐵路學(xué)院有哪些，均以“鐵路學(xué)院”命名，并冠以該院校所在地名；鐵道部直屬高校本科為五年，其他的為四年，專科為三年或兩年。1959年6月鐵道部在全路高等學(xué)校內(nèi)確定3所重點(diǎn)學(xué)校，為唐山鐵道學(xué)院、北京鐵道學(xué)院、蘭州鐵道學(xué)院。

1961年3月鐵道部在衡陽召開鐵路高等和中等專業(yè)教育工作會(huì)議。會(huì)議討論了貫徹中央“調(diào)整、鞏固、充實(shí)、提高”八字方針問題，具體研究了：關(guān)于鐵路高等學(xué)校及中等專業(yè)學(xué)校進(jìn)行調(diào)整“四定”的初步方案；關(guān)于鐵路高等學(xué)校及中等專業(yè)學(xué)校進(jìn)行充實(shí)提高的初步方案；鐵道部《關(guān)于設(shè)置全路重點(diǎn)高等學(xué)校和重點(diǎn)中等專業(yè)學(xué)校的決定（草案）》；《關(guān)于鐵路高等學(xué)校及中等專業(yè)學(xué)校機(jī)構(gòu)編制的暫行規(guī)定（草案）》；鐵路高等及中等專業(yè)學(xué)校專業(yè)目錄。4月鐵道部確定5所全路重點(diǎn)高等院校：北京鐵道學(xué)院、唐山鐵道學(xué)院、蘭州鐵道學(xué)院、長沙鐵道學(xué)院、南京鐵道醫(yī)學(xué)院。

1961年5月11日鐵道部下發(fā)《鐵路高等及中等專業(yè)學(xué)校調(diào)整“四定”的初步方案》經(jīng)衡陽會(huì)議確定，鐵路高等學(xué)校由 1960年末的57所(工科39所、醫(yī)科11所、師范7所)，調(diào)整為25所(工科18所、醫(yī)科5所、師范2所)；鐵路中等專業(yè)學(xué)校由1960年末的109所(工科58所、醫(yī)科41所、師范10所)，調(diào)整為71所（工科40所、醫(yī)科26所、師范5所)。

1961年8月21日至31日鐵道部在哈爾濱召開全路教育工作會(huì)議，貫徹7月3日至15日教育部召開的全國高等學(xué)校及中等專業(yè)學(xué)校調(diào)整工作會(huì)議關(guān)于“縮短戰(zhàn)線、壓縮規(guī)模、合理布局、提高質(zhì)量"的精神。再次討論研究鐵路高等學(xué)校、中等專業(yè)學(xué)校及技工學(xué)校調(diào)整方案。會(huì)議討論研究了：①《鐵路文化教育工作條例)共6章48條；②《關(guān)于鐵路高等、中等專業(yè)學(xué)校和技工學(xué)校調(diào)整和“四定”的意見)；③《鐵路高等學(xué)校“四定”方案(草案》及各專業(yè)人數(shù)分配表；《鐵路中等專業(yè)學(xué)校“四定"方案(草案))及專業(yè)人數(shù)分配表；《鐵路技工學(xué)校“四定"方案(草案)》。對3月衡陽會(huì)議確定的鐵路高等學(xué)校、中等專業(yè)學(xué)校調(diào)整方案進(jìn)行再次調(diào)整，鐵路高等學(xué)校由25所調(diào)整為19所(工科14所、醫(yī)科5所)，鐵路中等專業(yè)學(xué)校由71所調(diào)整為51所(工科35所、醫(yī)科16所)，鐵路技工學(xué)校由58所調(diào)整為46所。

1961年11月5日鐵道部報(bào)送教育部《關(guān)于鐵路高等及中等專業(yè)學(xué)校進(jìn)一步調(diào)整方案及1962年招生計(jì)劃意見》，決定鐵路高等學(xué)校由8月哈爾濱會(huì)議確定保留的19所鐵路學(xué)院有哪些，再次調(diào)整為保留11所(北京、唐山、蘭州、長沙、大連、上海、哈爾濱鐵道學(xué)院，北京、南京、上海、大連鐵道醫(yī)學(xué)院)；鐵路中等專業(yè)學(xué)校由確定保留的51所(后來又調(diào)整為46所)，再次調(diào)整為保留39所(到1962年初又將保留中專學(xué)校增加到42所)。